MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium 104 chromosome

Total Repeats: 137969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008595	CTG	2	6	199605	199610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118462865
5002	NC_008595	GCC	2	6	199611	199616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462865
5003	NC_008595	CCGGGC	2	12	199619	199630	0 %	0 %	50 %	50 %	118462865
5004	NC_008595	CGG	2	6	199664	199669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118462865
5005	NC_008595	GC	3	6	199717	199722	0 %	0 %	50 %	50 %	118462865
5006	NC_008595	CGC	2	6	199747	199752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462865
5007	NC_008595	GCG	2	6	199801	199806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118462865
5008	NC_008595	CTG	2	6	199877	199882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118462480
5009	NC_008595	ATC	2	6	199889	199894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118462480
5010	NC_008595	GGA	2	6	199939	199944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118462480
5011	NC_008595	CGA	2	6	199947	199952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118462480
5012	NC_008595	GC	4	8	199963	199970	0 %	0 %	50 %	50 %	118462480
5013	NC_008595	CCA	2	6	199974	199979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118462480
5014	NC_008595	GGC	2	6	200058	200063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118462480
5015	NC_008595	GGT	2	6	200083	200088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118462480
5016	NC_008595	GCC	2	6	200169	200174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462480
5017	NC_008595	TCG	2	6	200178	200183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118462480
5018	NC_008595	CGA	2	6	200188	200193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118462480
5019	NC_008595	GCCG	2	8	200197	200204	0 %	0 %	50 %	50 %	118462480
5020	NC_008595	TCG	2	6	200205	200210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118462480
5021	NC_008595	CGG	2	6	200242	200247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118462480
5022	NC_008595	CAC	2	6	200266	200271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118462480
5023	NC_008595	GCG	2	6	200295	200300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118462480
5024	NC_008595	CCG	2	6	200370	200375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462480
5025	NC_008595	TGG	2	6	200415	200420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118462480
5026	NC_008595	CGGTG	2	10	200431	200440	0 %	20 %	60 %	20 %	118462480
5027	NC_008595	ACC	2	6	200475	200480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118462480
5028	NC_008595	CGG	3	9	200490	200498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118462480
5029	NC_008595	CGG	2	6	200545	200550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118462480
5030	NC_008595	CGG	2	6	200554	200559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118462480
5031	NC_008595	ACTG	2	8	200594	200601	25 %	25 %	25 %	25 %	118462480
5032	NC_008595	GAC	2	6	200624	200629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118462480
5033	NC_008595	CGG	2	6	200701	200706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118462480
5034	NC_008595	CAT	2	6	200743	200748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118462480
5035	NC_008595	GTC	2	6	200756	200761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118462480
5036	NC_008595	GC	3	6	200853	200858	0 %	0 %	50 %	50 %	118462480
5037	NC_008595	TGC	2	6	200859	200864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118462480
5038	NC_008595	GTG	2	6	200893	200898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118462480
5039	NC_008595	GAG	2	6	200927	200932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118462480
5040	NC_008595	GCCGCT	2	12	200941	200952	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	118462480
5041	NC_008595	TCA	2	6	200955	200960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118462480
5042	NC_008595	GAC	2	6	200966	200971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118462480
5043	NC_008595	GC	3	6	200986	200991	0 %	0 %	50 %	50 %	118462480
5044	NC_008595	GAC	2	6	201062	201067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118462480
5045	NC_008595	TGG	2	6	201108	201113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118462480
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5048	NC_008595	CGA	2	6	201232	201237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118462480
5049	NC_008595	TCT	2	6	201261	201266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118462480
5050	NC_008595	GGT	2	6	201325	201330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118462480
5051	NC_008595	CGG	2	6	201336	201341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118462480
5052	NC_008595	GCC	3	9	201352	201360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462480
5053	NC_008595	GCC	2	6	201385	201390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462480
5054	NC_008595	CCCA	2	8	201491	201498	25 %	0 %	0 %	75 %	118462480
5055	NC_008595	GGT	2	6	201507	201512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118462480
5056	NC_008595	GAC	2	6	201544	201549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118462480
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5058	NC_008595	TGT	2	6	201606	201611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118462480
5059	NC_008595	CGA	2	6	201652	201657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118462480
5060	NC_008595	AGCA	2	8	201698	201705	50 %	0 %	25 %	25 %	118462480
5061	NC_008595	TGC	2	6	201723	201728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118462480
5062	NC_008595	GC	5	10	201840	201849	0 %	0 %	50 %	50 %	118467150
5063	NC_008595	GGC	3	9	201884	201892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118467150
5064	NC_008595	GC	3	6	201901	201906	0 %	0 %	50 %	50 %	118467150
5065	NC_008595	GCGCC	2	10	201920	201929	0 %	0 %	40 %	60 %	118467150
5066	NC_008595	GGCCGG	2	12	201941	201952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118467150
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5088	NC_008595	CG	4	8	202507	202514	0 %	0 %	50 %	50 %	118466206
5089	NC_008595	CCA	2	6	202539	202544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118466206
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5091	NC_008595	TGGC	2	8	202583	202590	0 %	25 %	50 %	25 %	118466206
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5104	NC_008595	TGG	2	6	202971	202976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118466206
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5112	NC_008595	GCCG	2	8	203233	203240	0 %	0 %	50 %	50 %	118465744
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5121	NC_008595	CTG	2	6	203403	203408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465744
5122	NC_008595	TGGG	2	8	203496	203503	0 %	25 %	75 %	0 %	118465744
5123	NC_008595	TGGCGC	3	18	203527	203544	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	118465744
5124	NC_008595	GCT	2	6	203570	203575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465744
5125	NC_008595	GCGCG	2	10	203584	203593	0 %	0 %	60 %	40 %	118465744
5126	NC_008595	GCC	2	6	203617	203622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118465744
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5130	NC_008595	TGG	2	6	203736	203741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118465744
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5143	NC_008595	GCT	2	6	204095	204100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465744
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5145	NC_008595	TGC	2	6	204115	204120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465744
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5149	NC_008595	CGG	2	6	204208	204213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118465744
5150	NC_008595	TGG	2	6	204214	204219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118465744
5151	NC_008595	CTG	2	6	204240	204245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465744
5152	NC_008595	TGC	2	6	204295	204300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465744
5153	NC_008595	CTGC	2	8	204314	204321	0 %	25 %	25 %	50 %	118465744
5154	NC_008595	CGT	2	6	204335	204340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465744
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5158	NC_008595	CGA	2	6	204470	204475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118465744
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5160	NC_008595	TCG	2	6	204502	204507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465744
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5224	NC_008595	G	6	6	207320	207325	0 %	0 %	100 %	0 %	118462597
5225	NC_008595	CGC	2	6	207326	207331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118462597
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5229	NC_008595	GCG	2	6	207428	207433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118462597
5230	NC_008595	ACG	2	6	207434	207439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118462597
5231	NC_008595	GAT	2	6	207444	207449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118462597
5232	NC_008595	GGCG	2	8	207456	207463	0 %	0 %	75 %	25 %	118462597
5233	NC_008595	CAG	2	6	207493	207498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118462597
5234	NC_008595	GCA	2	6	207503	207508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118462597
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5236	NC_008595	CGG	3	9	207540	207548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118462597
5237	NC_008595	GGCC	2	8	207570	207577	0 %	0 %	50 %	50 %	118462597
5238	NC_008595	TCG	2	6	207602	207607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118462597
5239	NC_008595	CGC	2	6	207833	207838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118463426
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5241	NC_008595	GTT	2	6	207860	207865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118463426
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5480	NC_008595	GCC	2	6	217136	217141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118465452
5481	NC_008595	CCGA	2	8	217176	217183	25 %	0 %	25 %	50 %	118465452
5482	NC_008595	CTCGA	2	10	217191	217200	20 %	20 %	20 %	40 %	118465452
5483	NC_008595	ACA	2	6	217216	217221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118465452
5484	NC_008595	CTG	2	6	217245	217250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465452
5485	NC_008595	CGA	2	6	217259	217264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118465452
5486	NC_008595	GCC	2	6	217284	217289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118465452
5487	NC_008595	CGGCC	2	10	217295	217304	0 %	0 %	40 %	60 %	118465452
5488	NC_008595	ATC	2	6	217305	217310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118465452
5489	NC_008595	TCGA	2	8	217380	217387	25 %	25 %	25 %	25 %	118465452
5490	NC_008595	CG	3	6	217409	217414	0 %	0 %	50 %	50 %	118465452
5491	NC_008595	GTG	2	6	217458	217463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118465452
5492	NC_008595	GAG	3	9	217491	217499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118465452
5493	NC_008595	CAT	2	6	217508	217513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118465452
5494	NC_008595	GCG	2	6	217519	217524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118465452
5495	NC_008595	GGT	2	6	217541	217546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118465452
5496	NC_008595	CGG	2	6	217592	217597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118465452
5497	NC_008595	CCG	2	6	217630	217635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118465452
5498	NC_008595	CG	3	6	217658	217663	0 %	0 %	50 %	50 %	118465452
5499	NC_008595	GCG	2	6	217689	217694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118465452
5500	NC_008595	GCT	2	6	217697	217702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118465452

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